از زمان استقلال جمهوری آذربایجان در سال ۱۹۹۱، روابط آن با اسرائیل بهصورت پیوسته در حال رشد بوده است. اسرائیل از نخستین کشورهایی بود که استقلال باکو را به رسمیت شناخت، و از همان زمان دو طرف همکاریهایی گسترده در زمینههای انرژی، تجارت، و بهویژه صنایع دفاعی آغاز کردند.